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瑞典于默奥大学对跨学科合作推动生物学研究

我们将越来越依赖其他学科的专家。“我们的研究小组一直在寻找合作机会。我们面临的问题涵盖从相当深奥的数学到同样复杂的编...
我们将越来越依赖其他学科的专家。

“我们的研究小组一直在寻找合作机会。我们面临的问题涵盖从相当深奥的数学到同样复杂的编程难题。对于下一代生物学研究而言,我们将越来越依赖其他学科的专家,因为单靠一个实验室已无法囊括所有必需的知识。”于默奥大学分子生物学系的研究员约翰·亨里克松(Johan Henriksson)这样说道。

“午餐 pitches”系列活动由于默奥大学的IceLab组织,旨在利用午休时间将来自不同领域的研究人员聚集在一起,通过简短而聚焦的演讲激发对话,推动新的合作。

亨里克松认为,这种形式完全契合生物学研究的未来发展方向。他提到了社会学家马克斯·韦伯(Max Weber)——早在19世纪末,韦伯就曾预言社会将变得愈发专业化,以至于个人将难以理解整体图景。而据亨里克松观察,这一趋势只会持续加速。

寻找机器学习领域的合作伙伴
在亨里克松的演讲中,重点介绍了一种由他的团队开发的新方法。该方法能够同时捕获多达一百万个细菌的基因组序列,但每个细菌仅分析其中的一小部分。通过能够逐一研究细菌个体,研究人员可以更清晰地了解,例如,抗生素耐药性是如何演化的。

“这无疑是一个庞大数据量的挑战,我们需要全新的工具来进行分析。目前我们只能一次研究一个细胞,而当数据如此稀疏时,这种方法显然难以奏效。”

他们的目标是开发一个机器学习模型、算法或数据结构,能够表征潜在的共享遗传变异,并填补已采样细胞之间的信息空白。

“在此基础上,我们或许还能同时完成基因序列的注释工作,比如判断存在哪些基因以及它们的功能。”

亨里克松渴望与机器学习、稀疏线性代数、向量数据库或先进数据结构领域的研究人员合作。他也看到了联邦式数据处理在这一领域的应用前景。

提炼问题的核心
他指出,面向广泛的跨学科听众演讲始终是一项挑战。

“你必须提炼出问题的核心。你认为最有趣的内容,未必能吸引听众的注意力。但这也正是你站上讲台的原因——你展示的问题,可能正是别人觉得兴奋的、需要不同类型专业知识参与解决的。”

他接着说道:

“甚至会有一些生物学领域的同行,现在才意识到我们拥有的可能性。这是一个充满前景的领域,我们正站在引领发展的前沿,因此,任何有商业头脑的人都应该加入我们。”

一次提议,开启一段对话
尽管建立新的合作从来都不容易,亨里克松认为,“午餐 pitches”这种形式是点燃灵感的绝佳途径之一。

“老实说,这并不容易,但可能是我们能做到的最好方式。一个提议只是一段对话的起点。真正的准备工作随后才开始——双方都必须对问题有足够深入的理解,才能为解决方案贡献智慧。魔鬼总是藏在细节里。”

在他看来,这类活动真正的力量,在于能够将一群思想开放的研究者聚集在同一个空间。

“现在,我们只需要把言语转化为行动!”